產(chǎn)品介紹

真菌基因組精細圖是利用三代測序技術(shù)和生物信息學分析手段，對真菌的基因組進行高精度繪制，它能夠提供真菌基因組的詳細信息，包括基因的數(shù)量、位置、結(jié)構(gòu)以及基因間的相互關(guān)系等諸多內(nèi)容，在真菌分類學、功能基因研究中發(fā)揮關(guān)鍵作用。在制藥行業(yè)，許多真菌能夠產(chǎn)生具有藥用價值的次級代謝產(chǎn)物，精細圖可以幫助挖掘真菌基因組中與這些產(chǎn)物合成相關(guān)的基因簇，加速藥物研發(fā)進程。

產(chǎn)品特點

1、高準確性

采用二代+三代測序方案，進行高深度測序，能夠獲取大量的基因組序列信息，減少測序錯誤和序列拼接的間隙。結(jié)合先進的生物信息學算法進行基因組組裝和注釋，能夠準確識別基因的邊界、外顯子和內(nèi)含子等結(jié)構(gòu)，對于復雜的基因區(qū)域（如重復序列區(qū)域）也能進行精準解析。

2、高分辨率細節(jié)呈現(xiàn)

可以精細到單堿基分辨率，能夠清晰地展示基因內(nèi)部的各種變異情況，如單核苷酸多態(tài)性（SNP）、插入缺失（InDel）等。不僅能夠確定基因的位置，還能詳細描繪基因上下游的調(diào)控區(qū)域，包括啟動子、增強子等元件的位置和序列信息，這對于研究基因表達調(diào)控機制至關(guān)重要。

結(jié)果展示

送樣建議

  樣品類型

    · 最常見的是新鮮的真菌組織。例如，對于絲狀真菌，可以采集其菌絲體部分；對于酵母等單細胞真菌，則收集處于對數(shù)生長期的細胞。

    · 也可以是經(jīng)過妥善保存的真菌樣本，如在液氮中速凍保存的真菌組織，或者是在特定保存液（如含有甘油等保護劑的緩沖液）中保存的真菌樣本。

  樣品量要求

   · 對于新鮮組織，絲狀真菌一般需要至少100-200毫克的菌絲體，確保含有足夠的基因組DNA用于測序。單細胞真菌如酵母，細胞數(shù)量建議達到10?-10?個左右。

   · 如果是保存的樣本，由于可能存在DNA降解等情況，樣本量可能需要適當增加，以保證能夠提取到足夠高質(zhì)量的基因組DNA用于構(gòu)建測序文庫。

  樣品質(zhì)量

  · 樣品應(yīng)盡量避免污染，特別是避免其他微生物（如細菌、其他真菌）的污染。在采集和處理樣品過程中，要嚴格遵守無菌操作規(guī)范。

  · 對于保存的樣品，要確保其保存條件良好，沒有發(fā)生明顯的DNA降解。可以通過瓊脂糖凝膠電泳等方法對提取的基因組DNA進行質(zhì)量檢測，觀察DNA條帶是否完整，沒有明顯的拖尾現(xiàn)象。