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PCR實驗介紹
實驗步驟
1. 取適量待測樣本加入液氮后研磨粉碎;
2. 用1ml Trizol將研磨樣本轉(zhuǎn)移到取到1.5ml EP管中;
3. 向1.5ml EP管中加入500ul酚氯,仿振蕩混勻后,靜止5分鐘;
4. 4℃ 12000rpm離心10分鐘,小心吸取上清于一新的1.5ml EP管中;
5. 向分離出的上清中加入700ul異丙醇,充分混勻;
6. 4℃ 12000rpm離心10分鐘,小心棄上清;
7. 用75%乙醇洗滌沉淀一次,室溫晾干;
8. 50ul DEPC水溶解RNA沉淀;
9. 瓊脂糖凝膠電泳檢測。
使用核酸濃度測定儀測定RNA濃度和純度,測量前先用溶解RNA用的DEPC水調(diào)零,操作方法如下:
1. 抬起樣品臂,把樣品加到檢測基座上;
2. 放下樣本臂,使用電腦上的軟件開始吸光值檢測。在上下兩個光纖之間會自動拉出一個樣品柱,然后進行檢測;
3. 當檢測完成后,抬起樣品臂,并用干凈的無塵紙把上下基座上的樣品擦拭干凈。
濃度測定
260nm處讀值為1表示40 ng RNA/μl。樣品RNA濃度計算公式為:A260 X 40 ng/μl。
純度檢測
RNA溶液的A260/A280的比值是一種RNA純度檢測方法,比值范圍1.8到2.1。即使比值超出這個范圍,RNA樣品也一樣可以用于一些普通實驗中如Northern雜交,RT-PCR和RNA酶保護實驗。
逆轉(zhuǎn)錄使用invitrogen的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒superscript III
1. 反應體系1建立:
RNA | 200ng(10uL) |
Oligo-dT | 1uL |
2. 混勻,離心。65℃,5分鐘,結(jié)束后置于冰上。
3. 反應體系2建立:
反應體系1 | 12uL |
dNTP(10uM) | 1uL |
0.1M DTT | 2uL |
5X Buffer | 4uL |
RT酶 | 1uL |
4. 混勻,離心。置于42℃,水浴60分鐘。
5. 取出后置于85℃,反應10分鐘,滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。
6. 反應結(jié)束后將產(chǎn)物置于-20℃待用。
1. Real time PCR反應體系建立:
cDNA | 2uL |
PCR mix | 10uL |
primer F | 1uL |
primer R | 1uL |
ddH2O | 6uL |
2. 體系混勻后,瞬離一下,置于熒光定量PCR儀上,按照以下條件反應:
3. Realtime PCR反應條件
步驟 | 溫度 | 時間 | 循環(huán)數(shù) |
預變性 | 95℃ | 5 min | 1 |
變性 | 95℃ | 10 sec | 40 |
退火 | 58℃ | 20 sec | |
延伸 | 72℃ | 20 sec | |
熔解曲線 | 95℃ | 15 sec | 1 |
60℃ | 60 sec | ||
95℃ | 15 sec |
結(jié)果示例:
合作流程:
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