產(chǎn)品介紹

全長微生物多樣性測序是一種基于三代PacBio測序平臺的高通量測序技術(shù)，它利用單分子實時測序（SMRT Cell）的方法對微生物的標(biāo)記基因（如細(xì)菌的16S rRNA基因、真菌的ITS區(qū)域）進行全長測序。這種技術(shù)能夠提供更全面的微生物群落結(jié)構(gòu)信息，包括物種組成、基因功能和代謝通路等，從而更真實地還原樣本中的微生物群落結(jié)構(gòu)。

產(chǎn)品特點

1、覆蓋度廣、讀長長、通量高、物種注釋準(zhǔn)確：Pacbio全長微生物多樣性測序技術(shù)結(jié)合了一代Sanger測序的讀長優(yōu)勢和Illumina測序的高通量優(yōu)勢，能夠?qū)⒓?xì)菌16S全長和真菌ITS全長完全測通，在細(xì)菌、真菌群落結(jié)構(gòu)分析中具有顯著優(yōu)勢。

2、超高準(zhǔn)確性：PacBio測序平臺CCS模式，minPasses≥5，能夠提供超高準(zhǔn)確性的測序結(jié)果。

3、種水平注釋：承諾注釋到“種”水平，種水平注釋平均注釋率≥60%，告別挑選測序引物的糾結(jié)時代，開啟種水平鑒定“新紀(jì)元”。

4、全長序列信息：全長序列中攜帶的特征信息更多，支持“種”水平的分辨率，避免了短讀長擴增子的PCR引物選擇會影響推斷的群落準(zhǔn)確性和某些細(xì)菌類群的敏感性。

5、CCS擴增子測序模式：結(jié)合DADA2軟件算法，可獲得單堿基/近零錯誤率的全長rRNA基因序列。

6、更高的數(shù)據(jù)質(zhì)量：PacBio CCS自我矯正模式可獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)。

7、更高的比對率：注釋到各分類水平的序列比對率更高。

8、更高的分辨率：16S全長序列分析到種分類水平。

分析內(nèi)容

結(jié)果展示

送樣建議

1.動物組織>0.3g，核酸不豐富部位,例如脂肪、成熟皮膚、骨頭等部位建議增加送樣量。
2.動物血液(哺乳類)>1mL；動物血液(紅細(xì)胞有核類)> 0.5mL，血清血漿需酌情增加送樣量。
3.唾液>4mL。
4.菌液(對數(shù)生長期)>4mL；菌體：對應(yīng)菌液離心后菌沉淀30-50μL；真菌菌絲>0.5g。
5.土壤：固體2g，液體2mL。
6.糞便、腸道內(nèi)容物、食糜≥1mL（離心管刻度）；瘤胃液>2mL，胃液有渾濁,離心送沉淀為佳。
7.水體(濾膜)：直徑4cm，濾膜3張，如果菌群豐度較低，建議增加送樣量。
8.拭子>4個，拭子表面有明顯顏色變化，達到富集微生物的目的。