一、蛋白序列分析

1、信號(hào)肽預(yù)測(cè)：

信號(hào)肽預(yù)測(cè)網(wǎng)站是一個(gè)提供在線服務(wù)的平臺(tái)，用于分析和預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)序列中的信號(hào)肽，幫助研究者了解蛋白質(zhì)的分泌途徑和定位機(jī)制

http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

2、跨膜區(qū)預(yù)測(cè)：

跨膜區(qū)預(yù)測(cè)網(wǎng)站是一個(gè)專業(yè)的生物信息學(xué)工具平臺(tái)，提供在線分析服務(wù)以預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)序列中的跨膜區(qū)域，幫助研究者了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能。

http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

3、結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)：

結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)網(wǎng)站是一個(gè)生物信息學(xué)分析平臺(tái)，專門用于預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)序列中的結(jié)構(gòu)域，為研究蛋白質(zhì)功能和結(jié)構(gòu)提供科學(xué)依據(jù)。

http://smart.embl-heidelberg.de/

4、蛋白性質(zhì)預(yù)測(cè)：

蛋白性質(zhì)預(yù)測(cè)網(wǎng)站是一個(gè)生物信息學(xué)工具平臺(tái)，提供在線服務(wù)以預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的物理化學(xué)性質(zhì)，如分子量、等電點(diǎn)、疏水性等，輔助科研人員進(jìn)行蛋白質(zhì)特性分析。

http://web.expasy.org/protparam/

5、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測(cè)：

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測(cè)網(wǎng)站是一個(gè)綜合性生物信息學(xué)平臺(tái)，提供蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)建模、功能分析和相關(guān)性質(zhì)預(yù)測(cè)，助力科研人員深入理解蛋白質(zhì)的生物學(xué)特性。

http://biotools.nubic.northwestern.edu/proteincalc.html

6、二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)：

二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)網(wǎng)站是一個(gè)專業(yè)的生物信息學(xué)工具，它提供在線服務(wù)以預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)，幫助科學(xué)家分析蛋白質(zhì)的折疊模式和功能特性

http://raptorx.uchicago.edu/

7、評(píng)估結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性：

評(píng)估結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性的網(wǎng)站通常是一個(gè)生物信息學(xué)平臺(tái)，提供工具和資源來驗(yàn)證蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型的科學(xué)性和實(shí)用性。

http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/

8、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)：

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)網(wǎng)站是一個(gè)生物信息學(xué)資源，利用計(jì)算模型和算法預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)、功能以及相關(guān)特性，為生物學(xué)研究和藥物設(shè)計(jì)提供科學(xué)依據(jù)

https://www.cameo3d.org/

9、三維結(jié)構(gòu)比對(duì)：

三維結(jié)構(gòu)比對(duì)網(wǎng)站是一個(gè)專業(yè)的生物信息學(xué)工具，提供在線服務(wù)以比較和分析蛋白質(zhì)或核酸的三維結(jié)構(gòu)，幫助研究者理解分子間的相似性和差異性

https://open.predictprotein.org/

10、同源建模：

同源建模網(wǎng)站是一個(gè)生物信息學(xué)平臺(tái)，提供基于已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的序列同源性分析，預(yù)測(cè)未知蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)模型

https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/

11、預(yù)測(cè)蛋白相互作用：

預(yù)測(cè)蛋白相互作用的網(wǎng)站是一個(gè)生物信息學(xué)工具平臺(tái)，利用計(jì)算方法預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)之間的潛在相互作用關(guān)系，幫助科研人員理解生物分子網(wǎng)絡(luò)

https://string-db.org/

12、Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)是蛋白質(zhì)家族的集合（根據(jù)結(jié)構(gòu)域分類）:

Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)權(quán)威的蛋白質(zhì)家族資源，提供基于結(jié)構(gòu)域的分類和注釋，幫助研究者識(shí)別和分析蛋白質(zhì)家族的功能和進(jìn)化關(guān)系

http://pfam.xfam.org/

二、新藥研發(fā)常用數(shù)據(jù)庫(kù)及網(wǎng)站

1、Chemical Index Database:

化學(xué)物質(zhì)索引數(shù)據(jù)庫(kù)

www.drugfuture.com/chemdata/index.aspx

2、Inactive Ingredient Search for Approved Drug Products:

美國(guó)FDA批準(zhǔn)藥物非活性成分?jǐn)?shù)據(jù)

www.drugfuture.com/fda/IIG_query.aspx

3、U.S. FDA Drugs Database:

美國(guó)FDA藥品數(shù)據(jù)庫(kù)

https://www.drugfuture.com/fda/

4、Chinese Marketed Drugs Database:

中國(guó)藥品注冊(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)

www.drugfuture.com/cndrug/

5、Chemical Toxicity Database：

化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫(kù)

www.drugfuture.com/toxic/

6、Drugbank：

藥物綜合數(shù)據(jù)庫(kù)

https://go.drugbank.com/

7、Medpeer藥學(xué)中心：

Medpeer藥學(xué)中心是一個(gè)專業(yè)的藥學(xué)信息平臺(tái)，提供藥物知識(shí)、研究數(shù)據(jù)和藥學(xué)服務(wù)，旨在促進(jìn)醫(yī)學(xué)專業(yè)人士的學(xué)術(shù)交流和臨床決策

http://pharmacy.medpeer.cn/

8、美國(guó)FDA批準(zhǔn)藥物非活性成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)：

美國(guó)FDA批準(zhǔn)藥物非活性成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)提供FDA上市產(chǎn)品中包含的輔料信息數(shù)據(jù)的資源，支持模糊查詢，檢索結(jié)果包括非活性成分名稱、給藥途徑、劑型、CAS登記號(hào)、美國(guó)藥典/FDA物質(zhì)登記系統(tǒng)標(biāo)識(shí)碼以及處方中輔料使用量，為藥物研究提供輔料的安全用量的事實(shí)性數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)更新與FDA同步

https://www.drugfuture.com/fda/IIG_query.aspx

9、FDA藥品注冊(cè)法規(guī)：

美國(guó)FDA藥品注冊(cè)法規(guī)網(wǎng)站提供了全面的新藥注冊(cè)解讀，包括臨床前研究、新藥臨床試驗(yàn)申請(qǐng)（IND）、藥品上市許可申請(qǐng)（NDA）等流程，以及相關(guān)的藥品注冊(cè)管理辦法和規(guī)定，確保藥品的安全性、有效性和質(zhì)量可控性

https://www.registrarcorp.com/

10、藥用輔料手冊(cè)：

藥用輔料手冊(cè)網(wǎng)站是一個(gè)提供藥用輔料詳細(xì)信息和使用指南的資源平臺(tái)，幫助制藥專業(yè)人士了解和選擇合適的輔料以確保藥品的安全性和有效性

https://www.drugfuture.com/excipients/browser.html

11、藥品標(biāo)準(zhǔn)查詢數(shù)據(jù)庫(kù)：

藥品標(biāo)準(zhǔn)查詢數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)提供藥品標(biāo)準(zhǔn)信息的在線平臺(tái)，允許用戶檢索和獲取藥品的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、成分和生產(chǎn)規(guī)范等詳細(xì)資料

https://www.drugfuture.com/standard/index.html

12、ICH指南：

國(guó)際人用藥品注冊(cè)技術(shù)協(xié)調(diào)會(huì)

https://www.ich.org/

13、美國(guó)藥典在線：

ICH指南網(wǎng)站是一個(gè)國(guó)際性平臺(tái)，提供國(guó)際協(xié)調(diào)會(huì)議（International Council for Harmonisation of Technical Requirements for Pharmaceuticals for Human Use，簡(jiǎn)稱ICH）制定的關(guān)于藥品質(zhì)量、安全性和有效性評(píng)價(jià)的統(tǒng)一技術(shù)指南，旨在促進(jìn)全球藥品注冊(cè)的協(xié)調(diào)與一致性

https://www.drugfuture.com/Pharmacopoeia/usp32/

14、美國(guó)藥典委員會(huì)USP：

美國(guó)藥典委員會(huì)USP網(wǎng)站是一個(gè)權(quán)威的藥典資源平臺(tái)，提供關(guān)于藥品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、鑒定方法和相關(guān)信息的詳細(xì)指南，其出版的《美國(guó)藥典/國(guó)家處方集》（USP/NF）是藥品生產(chǎn)、使用、管理、檢驗(yàn)的法律和技術(shù)依據(jù)

https://www.usp.org/

15、歐洲藥典委員會(huì)EDQM：

歐洲藥典委員會(huì)EDQM網(wǎng)站是提供歐洲藥典（European Pharmacopoeia）的官方資源，包括藥品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、測(cè)試方法和指南，是歐洲藥品監(jiān)管和質(zhì)量控制的權(quán)威參考

https://www.edqm.eu/en/home

16、國(guó)家藥典委員會(huì)：

國(guó)家藥典委員會(huì)網(wǎng)站是中國(guó)藥品標(biāo)準(zhǔn)制定和發(fā)布的官方平臺(tái)，提供中國(guó)藥典（ChP）的詳細(xì)信息、藥品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和相關(guān)法規(guī)，是藥品研發(fā)、生產(chǎn)和監(jiān)管的重要參考

https://www.chp.org.cn/

17、美國(guó)藥品監(jiān)督管理局FDA：

美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）網(wǎng)站是提供藥品、食品、化妝品等產(chǎn)品監(jiān)管信息的官方平臺(tái)，確保其安全性、有效性和質(zhì)量合規(guī)，保護(hù)公眾健康

https://www.fda.gov/

18、歐洲藥品監(jiān)督管理局EMA：

歐洲藥品監(jiān)督管理局（EMA）網(wǎng)站是一個(gè)提供藥品監(jiān)管信息、指南和資源的官方平臺(tái)，致力于評(píng)估、監(jiān)督和保護(hù)歐盟內(nèi)藥品的質(zhì)量和安全性

https://www.ema.europa.eu/en

19、國(guó)家藥品監(jiān)督管理局NMPA：

國(guó)家藥品監(jiān)督管理局（NMPA）網(wǎng)站是中國(guó)藥品監(jiān)管的官方平臺(tái)，提供藥品、醫(yī)療器械、化妝品的監(jiān)管政策、法規(guī)、安全信息以及相關(guān)服務(wù)，確保公眾用藥安全有效

https://www.nmpa.gov.cn/

20、中華試劑網(wǎng)：

中華試劑網(wǎng)是一個(gè)提供化學(xué)試劑、生物試劑及相關(guān)實(shí)驗(yàn)耗材的在線采購(gòu)平臺(tái)，致力于滿足科研和工業(yè)領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)需求

http://www.labgogo.com/

21、國(guó)家藥品監(jiān)督管理局藥品審評(píng)中心CDE：

國(guó)家藥品監(jiān)督管理局藥品審評(píng)中心（CDE）網(wǎng)站是中國(guó)藥品技術(shù)審評(píng)的官方平臺(tái)，負(fù)責(zé)藥品注冊(cè)申請(qǐng)的審評(píng)工作，提供審評(píng)指南、政策法規(guī)和審評(píng)進(jìn)度查詢等服務(wù)，確保藥品的安全性、有效性和質(zhì)量可控

https://www.cde.org.cn/

22、Handbook of Pharmaceutical Excipients：

藥用輔料手冊(cè)
www.drugfuture.com/excipients

三、蛋白質(zhì)及核酸序列

搜索/處理工具

1、NCBI Blast:

比對(duì)查找核酸或蛋白質(zhì)序列

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cg

2、Clustal Omega:

在線多序列比對(duì)工具

https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/

3、Primerbank:

查詢?nèi)撕托∈蟮膓RT-PCR引物

https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/

4、CHOPCHOP:

sgRNA序列設(shè)計(jì)

http://chopchop.cbu.uib.no/

5、CRISPick：

sgRNA序列設(shè)計(jì)網(wǎng)站

https://portals.broadinstitute.org/gppx/crispick/public

6、GFP portal：

shRNA序列查詢網(wǎng)站

https://portals.broadinstitute.org/gpp/public/gene/search,

7、Addgene：

最全的質(zhì)粒序列庫(kù)

https://www.addgene.org/

8、Snapgene Plasmids：

收錄大量的標(biāo)準(zhǔn)化、商業(yè)化質(zhì)粒序列

https://www.snapgene.com/resources/plasmid-files/

四、在線計(jì)算

1、chemcalc:

ChemCalc是一個(gè)在線化學(xué)計(jì)算工具網(wǎng)站，提供化學(xué)方程式平衡、溶液濃度計(jì)算等功能，幫助用戶進(jìn)行化學(xué)相關(guān)的數(shù)值分析和數(shù)據(jù)處理

https://www.chemcalc.org/?mf=RuClH(CO)(PPh3)3&isograph=on

2、NCBI (National Center for Biotechnology Information):

提供生物信息學(xué)和生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)庫(kù)和工具，此外還包括PubMed、GenBank等，都是咱們科研人必備呢

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

3、Ensembl：

提供基因組注釋、基因定位、序列比對(duì)等生物信息學(xué)數(shù)據(jù)和工具

http://ensemblgenomes.or

4、UCSC Genome Browser：

提供廣泛的基因組數(shù)據(jù)、注釋信息和工具，用于基因組瀏覽與分析

http://genome.ucsc.edu/  

5、Expasy：

提供生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和工具，涵蓋蛋白質(zhì)序列分析、結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、蛋白質(zhì)功能預(yù)測(cè)等

https://www.expasy.org/

6、STRING：

提供蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和功能注釋信息，用于蛋白質(zhì)互作預(yù)測(cè)和功能研究

https://cn.string-db.org/  

7、DAVID Bioinformatics Resources：

提供基因功能注釋、通路分析、蛋白質(zhì)互作等生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析工具

https://david.ncifcrf.gov/home.jsp

8、Bioconductor：

提供用于R編程語(yǔ)言的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析工具和軟件包

http://master.bioconductor.org/

9、GeneCards：

提供人類基因的綜合信息和注釋數(shù)據(jù)庫(kù)，用于基因的功能和表達(dá)分析

https://www.genecards.org

10、Pfam：

提供蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫(kù)，用于蛋白質(zhì)序列分析和功能預(yù)測(cè)

https://pfam.my/  

11、EMBL-EBI：

歐洲生物信息研究所提供的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)資源和工具，包括EMBL數(shù)據(jù)庫(kù)、ENA數(shù)據(jù)庫(kù)等

https://www.ebi.ac.uk/

五、基因表達(dá)

分析工具/網(wǎng)站

1、GEPIA：

基因表達(dá)分析平臺(tái)。

http://gepia.cancer-pku.cn/

2、Kaplan-Meier：

基于基因表達(dá)量的生存分析。

https://kmplot.com/analy

3、R2：

基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)。

https://hgserver1.amc.nl/cgi-bin/r2/main.cgi

六、PDF格式轉(zhuǎn)化

1、wondershare：

Wondershare是一個(gè)提供多媒體編輯軟件和在線服務(wù)的公司，專注于幫助用戶輕松創(chuàng)建、編輯和分享視頻、音頻和圖片內(nèi)容

https://www.hipdf.com/

2、CleverPDF：

CleverPDF是一個(gè)在線PDF工具網(wǎng)站，提供快速、簡(jiǎn)便的PDF轉(zhuǎn)換、編輯和壓縮服務(wù)，幫助用戶高效地處理PDF文檔

https://www.cleverpdf.com/cn

3、I LOVE PDF：

是一個(gè)提供全面PDF處理功能的在線平臺(tái)，允許用戶免費(fèi)轉(zhuǎn)換、編輯、合并和分割PDF文件，以及進(jìn)行其他PDF相關(guān)操作

https://www.ilovepdf.com/zh-cn

4、ALL TO ALL在線格式轉(zhuǎn)換：

ALL TO ALL是一個(gè)多功能的在線格式轉(zhuǎn)換平臺(tái)，支持多種文件格式之間的互轉(zhuǎn)，使用戶能夠輕松轉(zhuǎn)換文檔、圖片、視頻和音頻文件

https://www.alltoall.net/

七、專利查詢類

1、國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局：

國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局網(wǎng)站是中國(guó)政府官方平臺(tái)，提供知識(shí)產(chǎn)權(quán)相關(guān)的法律法規(guī)、政策資訊、專利檢索和申請(qǐng)服務(wù)，致力于保護(hù)和促進(jìn)創(chuàng)新成果

https://www.cnipa.gov.cn/

2、中國(guó)專利下載：

中國(guó)專利下載網(wǎng)站是一個(gè)提供專利文獻(xiàn)檢索、下載和相關(guān)信息服務(wù)的平臺(tái)，方便用戶獲取中國(guó)專利的詳細(xì)信息和文檔

https://www.drugfuture.com/cnpat/cn_patent.asp

3、專利在線：

專利在線網(wǎng)站是一個(gè)提供專利檢索、分析和下載服務(wù)的平臺(tái)，旨在幫助用戶快速訪問和管理專利信息

https://www.patent9.com/

八、分子克隆

1、引物Tm值計(jì)算：

引物Tm值計(jì)算網(wǎng)站是一個(gè)在線工具，用于預(yù)測(cè)DNA或RNA引物的熔解溫 度（Tm），幫助科研人員設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)中使用的PCR引物，確保實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和效率

http://biotools.nubic.northwestern.edu/OligoCalc.html

2、密碼子優(yōu)化：

密碼子優(yōu)化網(wǎng)站提供在線服務(wù)，幫助科研人員根據(jù)目標(biāo)生物體的密碼子使用偏好優(yōu)化基因序列，以提高外源基因在宿主細(xì)胞中的表達(dá)效率

https://sg.idtdna.com/CodonOpt

3、質(zhì)粒圖譜分析：

質(zhì)粒圖譜分析網(wǎng)站是一個(gè)在線工具平臺(tái)，提供質(zhì)粒DNA的可視化編輯、分析和設(shè)計(jì)功能，幫助科研人員構(gòu)建和優(yōu)化遺傳載體

http://wishart.biology.ualberta.ca/PlasMapper/

4、啟動(dòng)子信息：

啟動(dòng)子信息網(wǎng)站是一個(gè)生物信息學(xué)資源，提供關(guān)于基因啟動(dòng)子區(qū)域的詳細(xì)信息和分析工具，幫助科研人員理解基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制

https://blog.addgene.org/plasmids-101-the-promoter-region

5、addgene（一個(gè)質(zhì)粒數(shù)據(jù)庫(kù)）：

Addgene是一個(gè)非營(yíng)利性的質(zhì)粒共享平臺(tái)，提供科研人員用于基因克隆、表達(dá)和RNA干擾等多種生物學(xué)研究的質(zhì)粒資源，支持全球科學(xué)社區(qū)的實(shí)驗(yàn)需求

http://www.addgene.org/vector-database/

6、NEB 內(nèi)切酶buffer推薦：

NEB（New England Biolabs）網(wǎng)站提供內(nèi)切酶及其相應(yīng)的緩沖液推薦信息，幫助科研人員選擇合適的酶和buffer系統(tǒng)進(jìn)行分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

九、蛋白表達(dá)與純化

1、蛋白表達(dá)菌株信息：

蛋白表達(dá)菌株信息網(wǎng)站是一個(gè)生物技術(shù)資源平臺(tái)，提供各種用于蛋白表達(dá)的細(xì)菌、酵母和哺乳動(dòng)物細(xì)胞菌株的詳細(xì)信息，幫助科研人員選擇最適合其研究目的的表達(dá)系統(tǒng)

http://wolfson.huji.ac.il/expression/bac-strains-prot-exp.html

2、蛋白純化：

蛋白純化網(wǎng)站通常提供蛋白質(zhì)分離和純化的方法、技術(shù)指南和相關(guān)產(chǎn)品信息，幫助科研人員優(yōu)化實(shí)驗(yàn)流程以獲得高純度的蛋白質(zhì)樣品

http://wolfson.huji.ac.il/purification/Purification_Protocols.html

十、AI大語(yǔ)言模型

資源網(wǎng)站

1、Globe explorer：

Globe explorer基于LLMs等大型語(yǔ)言模型，根據(jù)輸入的關(guān)鍵詞或提問，利用AI篩選結(jié)果，構(gòu)建出一個(gè)目標(biāo)信息有關(guān)的知識(shí)圖譜，以思維導(dǎo)圖的形式進(jìn)行呈現(xiàn)。我們可以免費(fèi)/無注冊(cè)地使用GPT-3.5和Haiku的版本進(jìn)行圖譜構(gòu)建

https://explorer.globe.engineer/

2、Pi：

Pi是一個(gè)為公眾號(hào)提供內(nèi)容管理和互動(dòng)工具的平臺(tái)，旨在增強(qiáng)用戶參與度和提升內(nèi)容表現(xiàn)力

https://pi.ai/onboarding

3、Kimi：

KIMI是一個(gè)多功能的人工智能助手，專為公眾號(hào)提供智能內(nèi)容創(chuàng)作、管理和用戶互動(dòng)服務(wù)，以提升用戶體驗(yàn)和運(yùn)營(yíng)效率

http://kimi.moonshot.cn

十一、實(shí)驗(yàn)方案類

1、call for lab-tested protocols：

"Call for Lab-Tested Protocols" 網(wǎng)站是一個(gè)平臺(tái)，致力于征集和分享經(jīng)過實(shí)驗(yàn)室測(cè)試驗(yàn)證的科學(xué)協(xié)議和方法，以促進(jìn)科研交流和技術(shù)創(chuàng)新。

https://star-protocols.cell.com/search