實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目
Label free蛋白質(zhì)組
實(shí)驗(yàn)介紹：
Label free是一種不依賴于同位素標(biāo)記的非標(biāo)記蛋白組定量技術(shù)，通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)標(biāo)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度，從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。
實(shí)驗(yàn)流程：
應(yīng)用方向：
生物領(lǐng)域各個(gè)研究方面，如：
1.農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機(jī)制，生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制，育種保護(hù)研究等
2.畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機(jī)理研究等
3.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機(jī)理機(jī)制，疾病分型，個(gè)性化治療等
4.生物醫(yī)藥：藥物作用機(jī)理，藥效評(píng)價(jià)，藥物開發(fā)等
5.微生物領(lǐng)域：致病機(jī)理，耐藥機(jī)制，病原體-宿主相互作用研究等
6.海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
7.生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等
8.食品營(yíng)養(yǎng)：食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測(cè)等
數(shù)據(jù)分析
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
蛋白質(zhì)總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結(jié)果統(tǒng)計(jì)、差異結(jié)果統(tǒng)計(jì)、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質(zhì)功能分析 | 亞細(xì)胞定位、結(jié)構(gòu)域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
質(zhì)量控制分析 | 肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布 |
高級(jí)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
WGCNA共表達(dá)分析 | 獲得與表型強(qiáng)關(guān)聯(lián)的核心蛋白質(zhì) |
趨勢(shì)聚類分析 | 探討蛋白質(zhì)的表達(dá)趨勢(shì)模式 |
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
? 無需昂貴的同位素標(biāo)記試劑，實(shí)驗(yàn)周期短
? 可用于不同物種間的“有無差異蛋白”比較
? 克服標(biāo)記定量技術(shù)在樣本數(shù)量的上限制，靈活方便