其他檢測項目
TMT定量蛋白質(zhì)組學
實驗介紹
TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研發(fā)的一種多肽體外等重同位素標記的相對與絕對定量技術(shù)，采用6、10及16種同位素的標簽，通過特異性標記多肽的氨基基團，經(jīng)高分辨質(zhì)譜儀串聯(lián)分析，可同時比較多達16種樣品之間的蛋白質(zhì)表達量，是定量蛋白質(zhì)組學中經(jīng)典的高通量篩選技術(shù)
應用方向
生物領(lǐng)域各個研究方面，如：
? 農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等
? 畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等
? 基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治療等
? 生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等
? 微生物領(lǐng)域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
? 生物能源、環(huán)境科學領(lǐng)域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風險評估研究等
? 食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等
數(shù)據(jù)分析
標準數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
蛋白質(zhì)總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結(jié)果統(tǒng)計、差異結(jié)果統(tǒng)計、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質(zhì)功能分析 | 亞細胞定位、結(jié)構(gòu)域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
質(zhì)量控制分析 | 肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布 |
高級數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關(guān)聯(lián)的核心蛋白質(zhì) |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質(zhì)的表達趨勢模式 |
技術(shù)優(yōu)勢
? 同一批次標記的樣本統(tǒng)一處理，減少樣本處理及實驗誤差，實驗平行性較高
? 同一批次標記定量穩(wěn)定性高
? 通過分級方法可深度可大大增加蛋白鑒定深度