其他檢測項目
iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)
實驗介紹
iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技術(shù)是一種多肽體外標(biāo)記技術(shù)。該技術(shù)采用4-plex或8-plex同位素的標(biāo)簽，通過特異性標(biāo)記多肽的氨基基團，進(jìn)行LC-MS/MS分析，可同時比較多種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對表達(dá)含量
實驗流程
*包括蛋白質(zhì)定量、SDS-PAGE測試、酶解和質(zhì)譜分析，對樣本質(zhì)量及樣本之間的平行性進(jìn)行初步判斷。
應(yīng)用方向
生物領(lǐng)域各個研究方面，如：
? 農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護(hù)研究等
? 畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等
? 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治療等
? 生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等
? 微生物領(lǐng)域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
? 生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等
? 食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等
數(shù)據(jù)分析
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
蛋白質(zhì)總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結(jié)果統(tǒng)計、差異結(jié)果統(tǒng)計、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質(zhì)功能分析 | 亞細(xì)胞定位、結(jié)構(gòu)域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
質(zhì)量控制分析 | 肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布 |
高級數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
WGCNA共表達(dá)分析 | 獲得與表型強關(guān)聯(lián)的核心蛋白質(zhì) |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質(zhì)的表達(dá)趨勢模式 |
技術(shù)優(yōu)勢
? 具有2-8 plex標(biāo)簽，可同時標(biāo)記2-8組樣本進(jìn)行表達(dá)差異分析
? 是一種體外標(biāo)記技術(shù)，可標(biāo)記動物、植物、微生物、臨床、體液或細(xì)胞等多種樣本
? 不同標(biāo)簽混合后上機，具有較好的平行性，避免技術(shù)誤差，提高檢測效率
? 與凝膠方法相比，iTRAQ可發(fā)現(xiàn)膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、強堿和強酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白質(zhì)，對低豐度蛋白質(zhì)亦有較好的檢出率